Com uma imagem fortemente marcada pela gestão de sistemas de incentivos, o IAPMEI assumiu e continua a assumir, papéis diversificados e de claro pioneirismo, nas mais diversas áreas, actuando sobre as falhas de mercado, mas contribuindo também significativamente para a criação de mercado em domínios vitais para a competitividade das empresas portuguesas, através da sensibilização e informação.

Actualmente, o Quadro Comunitário de Apoio III, designadamente as exigências de operacionalização do Programa de Incentivos à Modernização da Economia (PRIME), constitui uma das vertentes prioritárias da actuação do Instituto.

Em simultâneo, o IAPMEI desenha e implementa novos programas e iniciativas para as empresas, com o objectivo de criar motores de desenvolvimento que contribuam para a prossecução das prioridades e objectivos delineados para a economia portuguesa nos próximos anos.